whether...or...引导的不是主语从句，而是状语从句，原句变成陈述句是：

Comprehension is the same whether a person reads a text onscreen or on paper.

一个人在屏幕上阅读文本或是在纸上阅读文本的理解是一样的。

句子的主语是 Comprehension。

不过，whether...or... 是可以引导主语从句的。如：

Whether they win or lose is all the same to me. 他们是赢是输于我都一样。

Whether we go Thursday or Friday is inconsequential. 我们星期四去还是星期五去都无关紧要。

Whether you stay or leave is a matter of total indifference to me. 你是留是走对我根本无所谓。