我的看法是：

1. what不可能是融合性关系代词，因为融合性关系代词不具有疑问意义，所以不可能置于疑问句句首。

2. 本句中不存在双重定语从句。如果you started to tell me in the restaurant和that you didn’t understand about me都是关系分句，那么这个句子就没有了主句。因为（what）was it只是分裂句的句式框架。

3. 本句不包含任何关系分句。you started to tell me in the restaurant是主句；that you didn’t understand (about me) 是tell（me）的宾语从句，句首的that是连接词，本来可以省略，但此句中与动词tell相隔较远，不宜省略；被前置于全句句首的what是宾语从句动词understand的宾语。

4. 原句的句法结构演变 ：为了简化结构，以下分析可不纳入in the restaurant（以及about me)

4.1原句还原成深层结构为：

You started to tell me (that-宾语从句引导词) you didn’t understand what（about me）..

4.2呈现的表层结构（非强调句）为：

  What did you start to tell me (that-宾语从句引导词，可省略) you didn’t understand (about me)?

4.3 强调what后呈现的分裂句：

What was it (that-分裂句结构词，可省略) you started to tell me that（宾语从句引导词，此处不宜省略）you didn’t understand (about me)？

你在评论区认为原句的大概意思是：在饭店的时候你告诉我你不了解我的什么？这表明你的理解与我的上述分析一致，但不知为什么一分析句子结构，你的思路就走样了。

以上供参考。