首先，你对gap的理解有误（不只是你，很多学生包括部分老师在这方面都理解有误）。所谓gap, 指的是比较分句中本应该有的成分缺失。这个缺失的成分可能是主语、宾语、表语、宾补，但也可能是状语。很多人只看比较分句的主谓宾都有，就误以为分句不缺成分，没有gap, 这种认识是错误的。例如，He runs as fast as you run. 很多人误以为这个比较分句中run是不及物动词，所以从句不缺成分。可以你自己分析主句和从句比较的是什么，是跑的速度，即比较的是方式状语。主句的方式状语是as fast，从句的方式状语在哪里呢？如果把as分析为连词不做成分，那么从句中的方式状语就是gap. 如果把as分析为比较替代词，as做了从句的方式状语，只有这种分析才能认为从句没有gap。He cooked the fish as his mother always does. (does=cooks the fish). 这个句子as从句引导的是方式状语从句。其实本质上是把他烧鱼的方式和他妈烧鱼的方式作比较，比较的结果是二人的烧鱼方式相同。所以as引导的方式状语从句身就是比较分句的句法功能之一，所以它也遵循比较分句的缩减原则。这个句子中主句是有方式状语的，既然是和他妈的烧鱼方式作比较，那么从句的does也应该有一个方式状语，可是这个方式状语是看不到的。如果把as分析为连词不做成分，则从句的方式状语就是gap. 如果把as分析为比较替代词，as不但引导方式状语从句，同时还在从句中作方式状语。这就是为什么as可以改为the way that。即He cooked the fish the way (that) his mother always does. 你可以看出，主句的方式状语为the way，从句的方式状语由关系副词that充当。即从句是有方式状语的。然后the way that融合为as, as既要引导方式状语从句在主句中作方式状语，同时还要在从句中作方式状语。

现在具体回答你的问题：

1 We will do works as planned.

= We will do works as is planned.

= We will do works as it is planned that we should do.

你要注意，我在解答时使用的术语是as引导的比较分句，而不是比较状语从句！比较分句是一种特定的分句，由as/than引导，分句常采用缩减形式。它只是一种分句类型。比较分句可以作不同的句子成分，例如可以作比较状语、方式状语、表语、补充语、名词的修饰语。即比较分句的句法功能并不是仅仅作比较状语，作比较状语只是比较分句的句法功能之一。所以，这个句子中as planned既是比较分句，也是方式状语从句。说它是比较分句，是说他的分句结构；说它是方式状语从句，是说它的句法功能，即在这个句子中做了什么成分。就好比，He is at home. 我们可以说at home 是介词短语，也可以说at Home是表语。前者说的是结构，后者说的是句法功能。而你对比较分句这个术语的含义有误，把它和方式状语对立起来，才产生了这个疑惑。所以学习语法，要注意准确理解语法术语的含义，尤其是读语法书的时候。

关于gap, 如果as引导比较分句，主句有as，so，such，the same与之呼应，则主句有比较项，as分句中的对应项为gap. 用gap解释的前提是as为连词，在从句中不做成分。如果把as分析为比较替代词，那么从句就不存在gap了。以下按照as为连词不做成分分析。

as引导比较分句，并非主句都有显现的比较项。例如下面这个句子：

Tom is tall, as his father is. 汤姆个子高，和他父亲一样。这个比较分句是补充语分句。分句中系词is后不可以再加表语，表语的位置就是gap. 从句主句结构可知，主句的比较项为tall。

As we know, water consists oxygen and hydrogen. as分句作评注性状语。及物动词know的宾语为gap. 比较项是主句内容，对应项是know的宾语从句，必须省略形成gap。

用剑桥英语语法的术语，as比较分句的使用取决于主句的管控项（governor），如果主句有so, as, such, same, 这个几个词就是管控项。如果主句不带管控项，则as自身就是管控项。

2.Sir Alexander Fleming did not, as legend would have it, look at the mold on a piece of cheese and get the idea for penicillin there and then. 这个句子中as分句还是作评注性状语。have it 后的that从句，而that从句就是比较对应项，和主句作比较，that从句必须省略，it后为gap.

第一句中的as it is planned that we should do. it为形式主语，that从句为外置主语从句。注意that从句并不是gap, gap是that从句中的方式状语。如果一个比较分句的gap不在as分句本身，而在as分句的潜入分句中 （例如本句中gap存在与that从句中，而that从句是as分句的主语，即that从句是一个潜入分句），则这个潜入分句可以省略。如果潜入分句是外置主语，则形式主语IT必须同时省略，不可以保留形式主语it。本句则不同，本句中，that从句本身就是一个gap, 是和主句作比较的对应项，that从句作为gap是必须省略的。而第一句中的that从句可以不省略（同时保留形式主语IT）。你的疑惑来自于你忽略的第一句中的gap的位置，即第一句中的gap是that从句中的一个成分，而第二句中gap是that从句本身。

3 这个句子其实到此你应该已经明白了，as引导的方式状语从句本身就是比较分句的一种。as分句中的方式状语方式状语是缺失的，那就是gap。