这完全是习惯问题，没有太多的理由可分析。

the universe的意思是“宇宙”，它习惯上要有the（你若细心的话，你在词典中可以看到the universe是用粗体字的形式呈现的，也就是说词典是把the universe当作一个整体来看待的）。例句：

The laws of physics are true throughout the universe. 物理学的规律适用于整个宇宙。

There are many gaps in our knowledge of the universe. 我们对宇宙的了解还有许多不足。

space的意思并不是“宇宙”，它指的是“太空”，也可指“外层空间”（=outer space），表示此意时它前面习惯上不用冠词。如：

The first flight into space marked a new epoch in the history of mankind. 第一次太空飞行标志着人类历史的新纪元。

Strange beings from outer space are still a popular subject for sci-fi films. 外星人仍是许多科幻电影流行的主题。