Protein increases satiation and satiety more so than the other two macronutrients, carbs and fats.

so 是个“替代词”，它可以替代一个词语、一个成分或者一个词组，甚至一个句子的谓语部分。在本句，它应该是替代前文中的一个“程度副词”，修饰 increases，比如 greatly（这是一句话，more 前面不可以加逗号）：

Protein increases satiation and satiety more greatly than the other two macronutrients, carbs and fats.

我也谈一下粗浅的看法供网友参考。

satiation和satiety是同义词，这两个词用and连接旨在加重语气。我觉得最好在more前加逗号：

Protein increases satiation and satiety, more so than the other two macronutrients, carbs and fats.蛋白质能增加饱食感和饱腹感，比其他两种常量营养物碳水化合物和脂肪更有效（即：更能增加饱食感和饱腹感）。

more so是much so的比较级，表示补充说明，常替代前面提到过的某个词或词组，也可替代含程度性的行为。例如：

Are you enjoying your holiday?   — "Very much so. 你的假期过得愉快吗？ —— 非常愉快。《柯林斯高阶英汉双解词典》

▲再给两个more so代替形容词的比较级的例句。

The band is popular and likely to become more so. 这支乐队很受欢迎，而且可能会越来越受欢迎。《朗文当代英语词典》

He's quite bright.  — well, certainly more so than his brother. 他相当聪明——嗯，肯定比他哥哥聪明得多。《剑桥高阶英语词典》

so 就是个代词，表示前面句子的某个成分。这里指增加饱足感和饱腹感increases satiation and satiety

感觉这句more so前面加个逗号更合理，  

Protein increases satiation and satiety, more so than the other two macronutrients, carbs and fats

句子翻译是这样的，蛋白质增加饱足感和饱腹感，（效果）比碳水化合物和脂肪更好。

否则的话，句子应该写成这样的比较级才合理。

Protein increases satiation and satiety to a greater extent than the other two macronutrients, carbs and fats, do. 

改动句子：蛋白质比碳水化合物和脂肪更能增加增加饱足感和饱腹感。