仔细一想，感觉两种理解都可以，但意思有所不同：

理解为定语从句：

And again, this is why it's so important to listen to your internal whisper. 　It's the same one that compelled Abraham Lincoln and Oskar Schindler to make the correct moral choices.

句意：而且，这也是为什么听从内心是如此重要的原因，同时也是迫使林肯和辛德勒做出正确的道德选择的原因。

理解为强调句：

And again, this is why it's so important to listen to your internal whisper. 　It's the same one that compelled Abraham Lincoln and Oskar Schindler to make the correct moral choices.

句意：而且，这就是为什么听从内心是如此重要的原因，同时也正是这个原因迫使林肯和辛德勒做出了正确的道德选择。

从前后语境来看，理解为强调句似乎更合适。