I'll go right after lunch.

right after=immediately after. 不可以改用just。

You are just in time.

这个句子just表示刚好准时，暗示差一点迟到，有almost not之意。所以不可以改为right。

有的词语意思接近，这里还有一个习惯问题，不可强行替换。解决的办法就是多读原文，多了解哪种场合用A，哪种场合多用B。不是坐在家里苦思冥想能解决问题的。所以，不必为此纠结。多阅读，建立语感。