1.为什么be done中的be是助动词？而have been done却是系动词？

这个问题中的假设本身就是不成立的。当我们谈论动词结构时用be done，就表示这是被动语态。系表结构是不会用这种表示方法的。同理have been done是完成体被动语态。既然是被动语态，那么be和been都是助动词，而不是系动词。

2.我们知道主系表结构可以倒装。但是表示被动也叫主系表结构吗？比如:The picture is fixed on the wall可以说成fixed on the wall is the picture.但是前面那个is是助动词，不是主系表结构呀，后面却是系动词，这怎么解释？这两个句子是相通的吗？

系表结构可以倒装（传统语法观点），这种倒装是完全倒装句。主语是要强调的内容，或主语带了比较长的修饰语，倒装后主语处于句末信息中心或句尾重心位置。

The picture is fixed on the wall.

这个句子是系表结构，而不是被动语态。注意这个句子是一般现在时，如果是被动语态表示动作，则这个动作必须是在说话时发生并结束。实际情况是说话时画已经在墙上了，所以这不是被动语态，而是系表结构表示主语在说话时的状态—已经固定在场上。网友的理解为被动语态是错误的。所以主语后移到句末，与表语互换位置，仍然是系表结构：

Fixed on the wall is a beautiful picture.

注意我将定冠词改为不定冠词，表示这是新信息。如果还用定冠词，则主语是已知信息，就没有倒装的必要，倒装就是错误的，至少是曲解了倒装的意义。

3.过去分词放句首倒装，比如：seated on the ground are a group of people.这里为什么还原不了？与第二题有什么关系呢？

这个句子完全可以还原成自然语序：

These people are seated on the ground. 这仍然是系表结构。我将泛指的a group of people改为these people，是因为一个句子通常应该以已知信息开头。原句用倒装语系，是因为主语是新信息，所以通过倒装使主语处于句末信息中心位置。而these people 为已知信息，作主语是很自然的。

4.主系表结构可以倒装。但是完成被动态不是主系表结构。比如the flag has been fasten to the hole.难道只有is am are的才能倒装吗？

既然这里讨论主系表结构的倒装，have been done这种被动语态自然不能随便使用完全倒装结构。但并不是只有is,am, are才能倒装。例如一个室内设计师谈论他的装修计划时，就可以说 On this wall will be a huge picture.