I know you’re sorry now, but the fact remains that you hit your sister.

【翻译】我知道你现在很难过，但事实是你打了你的妹妹。

我知道你现在很难过，但你打了你妹妹这个事实，在这儿摆着。

【分析】that you hit your sister是the fact的同位语（即同位语从句），remains 是不及物动词，意思是“仍然存在；仍然是”。

The fact remains that we do not have enough money. 

现实情况仍然是，我们没有足够的资金。

The stubborn fact remains that he has been arrested. 

不容否认的事实是他已被抓起来了。

The fact remains that we are behind the other groups. 

现实情况仍旧是我们比别的组落后。

The cold,hard fact remains that this is an enormous undertaking. 

但严峻的事实仍表明这是一个艰巨的任务。

The fact remains that we are still two teachers short. 

实际情况是我们还缺少两名教师。

But the fact remains that our manufacturers have a heavy backlog on hand. 

但是我们的厂家眼前生产任务硬度得很重，这是事实。

The fact remains that successful memorizing is the basis of all progress. 

事实都是这样:成功的记忆是一切进步的基础。

The fact remains that we are still lagging behind the other classes in maths. 

事实是我们在数学方面仍然比别的班落后。

【补充】因为这个结构比较特殊，为了更好地理解remain 这个用法，《柯林斯词典》单独把这个句子当作“系表结构”，这样把remain 视为系动词，后面的that 从句看作表语从句。所以，我也赞同童老师的观点。
The fact remains that inflation is unacceptably high...
事实是通货膨胀率仍高得离谱。
The question remains whether he was fully aware of the claims.
问题是他是否完全意识到了这些要求。