The twins went to university at Paris.

这个句子没有错。这里的介词 at 也可改成 in，不改也可以（就是你说的把 Paris 看作一个地点）。你可能对此没有把握，我给你一个依据。下面的内容摘自《牛津英语用法指南》：

这两个说法都可以，但意思不同，除了语境，这可能涉及还到文化背景知识。went to university at Paris. 这里的Paris 指巴黎大学这所学校，不是指巴黎的某一所大学，也不是指城市。如果说went to university in Paris. 这要看语境，因为本身是有歧义的，可以指大学，也可以指城市。

请看外刊例句：

这里的Oxford 指牛津大学，Harrow 指著名的哈罗公学。

Harvard 指校名哈佛大学，不是地名，哈佛大学的所在地是坎布里奇市（Cambridge)

Yale指耶鲁大学，它的所在地是New Haven (纽黑文市）

有时因为地名和校名相同，对不太熟悉这种用法的网友会产生困惑。我再举个例子：He went to university at Beijing. 这里应该指北大，而不是指北京市或北京的一所大学，除非改用in才有可能。如果是Fudan (复旦大学）就不会有问题了，因为大家都知道没有复旦这个地名。

也许网友还有疑问，有Paris University这个学校吗？那就请看外刊的例句：

【1】The twins went to university at Paris.

备注：以上用介词at 表示at some place in Paris,即表示在巴黎某个具体地点位置。

【2】The twins went to university in Paris

备注：以上用介词in 表示within the limit of Paris或者within an area of Paris，即表示在巴黎这个国家所在范围之内。

温馨提示：以上个人理解，不一定正确，仅供网友参考

The twins went to university at Paris.（错误）

The twins went to university  in Paris. （正确）

【理由】根据《朗文高级英语应试词典》第119-120页，at 与城市名或地名连用，表示旅途中停留的地方，但是其他情况用 in。

虽然把某地看着一个点，可以用at，但是这个“点”是有要求的，多半是指建筑（building）。如果是城市，除非像黎老师说的那样，只是中途停留，否则还是要用in. 见朗文字典的截图：

虽然学校前面也可用at，表示求学，但学校（school、Oxford并不属于city）毕竟给人的感觉是建筑群（building），而不是一座城市：

一家之言，仅供参考；

勤查英英，必有所获！