你造的句子，外国人不这么用，因此没必要进行区别了。第三句没问题。你这种方式学英语是错误方法。你要模仿外国人怎么用你就怎么用，不要在没有把握的情况下进行改造。

For John to win the marathon suprised us.

此句错误，因为动词不定式一般式（如本句的 to win）所表示的动作应该是和句中的谓语动词（如本句的suprised）所表示的动作同时或在其后发生。如：For her to lose the election would make me very happy. 她落选会使我很高兴。（《牛津英语用法指南》第四版113.9）

但是，以下结构更为常用：It would make me very happy for her to lose the election.（同上）

For John to have won the marathon suprised us.

此句正确。 to have won 是动词不定式的完成式，表示该动作发生在 suprised 之前。

  关于动名词与不定式作主语的区别，在赵俊英编著的《现代英语语法》中有比较详细的介绍（pp.393-395, 414-415,448-449等）。