No one had a slightest idea that the man should have stolen money from the company for a long time.
【翻译】谁也不知道这个人竟然长期以来一直在偷公司的钱。
该句不是虚拟语气，因为 “他偷了公司的钱是事实”，加 should 仅表示 “惊讶” 情绪，翻译为 “竟然”。如果不用 should 表示这种情绪，那么，主句使用一般过去时，从句使用过去完成时：
No one had a slightest idea that the man had stolen money from the company for a long time.

 should + 完成式，可以用来表达 “对过去所发生的情况，感到惊奇、愤怒、失望等情绪”，翻译时通常含有“竟然”的意味。
I wonder why he should have been so angry. 我想不通，他怎么会这样生气。
It is a pity that he should have failed in the exam. 他考试竟然没有及格，真是可惜。
It’s strange that he should have left without telling us. 奇怪，他竟没有和我们说一声就走了。
I'm surprised that he should have failed. 我很惊讶他竟然会失败。