A. had done + since: 

since前面的句子可以采用过去完成时态had done：

Since the party she had only spoken to him once.（那次派对之后，她只和他说过一次话。）

since既可以表示从过去到现在这段时间（说话人关心现在），也可以表示从过去到后来的另一个过去时间（说话人关心的是后一个过去时间）。本句中since就是后一种意义。这时主句用过去完成时。这样的句子是很多的。

B. was + since + had done:

since后边的从句也可以用过去完成时态：

It was exactly five years since her father had died. 

逻辑：她父亲死亡在先，过了五年，it was five years. 所以since从句用过去完成时表示过去的过去。since从句用一般过去时也可以，不至于导致误解。

C. had done + since + had done:

since前后都可以采用过去完成时态had done：

It was the first time I had had visitors since I had moved to London.（那是我搬到伦敦后第一次有人来看我。）

since从句的动作在had visitor之前，用过去完成时不算错。但since的语义决定了动作的先后，故从句的过去完成时属于多余，可以改用一般过去时，这样更为简洁。

D. ...since + have done:

since后边可以采用现在完成时态：

It's twenty years since I've seen her.（我和她有二十年没有见过面了。）

在这个句型中，现在完成时和一般过去时意义相同，现在完成时不及一般过去时常用。改为since I last saw her. 更为自然。

E. do + since + have done/have been doing:

since前面主句可以采用一般现在时态或现在进行时态：

You look great since you've been taking those exercise classes.

since从句用现在完成进行时表示该动作从过去一直持续到现在，look great的起点为现在完成进行时这个动作持续过程中的某一点。这个句子是非正式语体。主句谓语动词按理应该用现在完成时have looked.