当然是直接宾语。more freedom and more flexibility （更多的自由度和灵活性）：这是gave 的直接受事者，而banks 是间接的受事者。

give sb.（间接） sth.（直接）

These changes gave banks more freedom and more flexibility.

转换一下位置，就更清楚了：

These changes gave more freedom and more flexibility to banks.

【翻译】这些变化给了银行更多的自由度和更大的灵活性。