请问：非限定性定语从句中不可以使用that和why有具体原因吗？是违反上一级的语法规则还是因为逻辑不通？

我查阅了一些语法书籍，都说是习惯用法，可是这实在无法说服我，我总觉得背后还有更深层次的原因和逻辑。

解答如下：

要回答你这个问题，首先要搞清楚“限制性（restrictive）”和“非限制性（non-restrictive）”到底有什么区别：
(1)限制性：

In the room there are three chairs that are green. 

=In the room there are many chairs and some of them are green

其背后隐含的意思是，房间里有很多把椅子，其中三把是绿色的。

(that本书就属于指示代词，本身就是起用来区分其他名词的作用，即与其它名词有所不同的作用。that从本身指示代词转化为关系代词使用还保留指示语法功能含义。）

(2)非限制性：

In the room there are three chairs, which are green. 

=In the room there are three chairs and they are green.

这句话背后的意思是，房间里只有三把椅子，而且这三把椅子是绿色的。

(同样which本身就是一个疑问代词，在一个范围进行选择，其选择范围是包含整体全部内容，本身从疑问代词转化为关系代词也保留原来语法功能含义。)

根据上面句子我们可以看出限制性从句限缩了先行词的范围（把句子的主语从chairs变成了green chairs），所以叫“限制性”；而非限制性从句没有限缩先行词的范围（句子的主语一直都是chairs），可以理解为补充说明性”的插入语。

   对于英语惯用法方面的问题，通过学习记住就可以了。没有必要再找什么所谓的“具体原因”。例如,《牛津英语用法指南》第三版495.3 就回答了非限定性定语从句中不可以使用that的问题：“在非限制性定语从句中，很少用that.”“I lent him The Old Man and the Sea, which is really easy to read.我借给他《老人与海》，这本书很容易读。（不能说：... The Old Man and the Sea, that is really easy to read.）”“This is Naomi,who sells the tickets.这位是娜奥米，她卖车票。（不能说：This is Naomi,that sells the tickets.）”